Majoritatea cardurilor de memorie disponibile pe piață utilizează implicit sistemul de fișiere FAT32. Sistemele de fișiere NTFS și FAT32 diferă în următoarele moduri:

• Sistemul de fișiere FAT32 nu poate stoca fișiere individuale mai mari de 4 GB, în timp ce sistemul de fișiere NTFS poate face acest lucru.
• Sistemul de fișiere NTFS are o utilizare mai mare a hard disk-ului în comparație cu FAT32 și poate gestiona mult mai eficient spațiul de pe acesta.
• Vitezele de citire și scriere ale NTFS sunt, de asemenea, mai rapide decât cele ale FAT32.
• Sistemul de fișiere FAT32 este potrivit pentru dispozitivele cu memorie flash de capacitate mai mică (cum ar fi cardurile de memorie, dispozitivele USB și alte dispozitive de stocare), în timp ce sistemul de fișiere NTFS este potrivit pentru hard disk-uri cu capacitate mare.