На більшості карток пам’яті, доступних у продажу, за замовчуванням використовується файлова система FAT32. Файлові системи NTFS та FAT32 мають такі відмінності:

• У файловій системі FAT32 розмір окремого файлу не може перевищувати 4 Гбайт, водночас у файловій системі NTFS таких обмежень немає.
• Якщо порівнювати з FAT32, файлова система NTFS характеризується оптимальнішим використанням вільного місця, вона може керувати дисковим простором ефективніше.
• Швидкість читання й запису у файловій системі NTFS так само вища, ніж у FAT32.
• Файлова система FAT32 підходить для пристроїв флеш-пам’яті малого розміру (таких як картки пам’яті, USB-накопичувачі та інші запам’ятовувальні пристрої). Файлова система NTFS підходить для дисків великої ємності.